El Archivo Histórico Provincial de Guadalajara en su origen estuvo instalado en el Instituto de Enseñanza Secundaria Liceo Caracense y en la Diputación Provincial, hasta que en 1972 se traslada al Palacio del Infantado, junto con la Biblioteca Pública y el Museo Provincial de Guadalajara. Edificio singular, de estilo gótico flamenco construido en el siglo XV, en la época del II Duque del Infantado, Iñigo López de Mendoza, por el arquitecto borgoñón Juan Guas y por el tallista Egas Cueman.

En el 2013, se trasladó a su actual sede, edificio exnovo en la calle Julián Besteiro, 1-3 construido por el Ministerio de Educación, Cultura y Deporte obra de los arquitectos Luis Rojo de Castro, Begoña Fdez.-Shaw y Liliana Obal Díaz.

Edificio de seis plantas, con 24 depósitos de 180 m2 útiles cada uno distribuidos en varias plantas superpuestas lo que suponen unos 39.000 metros lineales de estantería, y se sitúan en torno a una espina central de circulación vertical y distribución horizontal para uso interno. Tiene más de 7.227 metros edificados, siendo casi el 50% destinado a depósitos documentales.

Dispone de un área de servicios internos, compuesta por un muelle de descarga, talleres, zona de tratamiento archivístico; un área administrativa con las oficinas y sala de reuniones; área de divulgación cultural: sala de consulta y atención al público, gran hall que sirve de sala de exposiciones, aula de formación, y un salón de actos para 120 localidades.