La documentación judicial originada por la función de justicia, desde la Edad Media hasta el siglo XX, es abundante en Cuenca aunque las pérdidas documentales a lo largo de la Historia han mermado en cantidad, que no en calidad, estos fondos documentales.

Un amplísimo abanico de casos civiles y criminales da buena cuenta de la conflictividad social durante siglos en esta zona. Además, es preciso señalar que como sucede con la documentación notarial, los Archivos municipales de Huete, San Clemente y Villanueva de la Jara conservan entre sus fondos numerosos pleitos de toda la Edad Moderna. Ellos permitirán realizar investigaciones lo más completas posibles. Esa documentación también está inventariada.

Debemos señalar que dentro de estos fondos judiciales se han conservado fondos de Tribunales Especiales: Tribunal Popular de Cuenca y Tribunal de Responsabilidades Políticas de Cuenca, que reflejan un período sociopolítico muy interesante: 1936 – 1942.