El castillo posee dos líneas defensivas, una muralla exterior, datada en el siglo XII y construida por Manrique de Lara (primer señor de Molina) que delimita una zona o albacara de grandes proporciones, con numerosas torres defensivas;  el otro espacio interior está formado por la fortaleza propiamente dicha, con seis torres, de las que se conservan restos de dos y otras cuatro en buen estado. Estas torres están comunicadas por un adarve almenado.

Como elemento exento y alejado del núcleo anterior aparece la Torre de Aragón. 

La muralla exterior dispone de cuatro puertas de acceso: la de Caballos al sur, la del Campo al este y las puertas de la Torre del Reloj o del Sol (principal) y Hogalobos al oeste.

La muralla interior dispone de dos puertas: la de la Traición al norte y la puerta situada al oeste entre las torres de los Caballeros y la de los Veladores; ésta última es la principal entrada al Castillo de Don Manrique.